中共中央南方局于1939年1月成立并设立常务委员会,周恩来任书记1939年6月1940年5月博古代理,周恩来、博古、凯丰、吴克坚、叶剑英、董必武任常务委员。1943年6月,周恩来回延安参加七大筹备工作和整风学习,南方局工作由董必武主持。南方局机构设在八路军驻重庆办事处内,设组织部、宣传部、妇女运动委员会、青年工作委员会、统战工作委员会、敌后工作委员会、国际问题研究室、文化工作委员会、华侨工作组、南洋工作组、社会部等工作机构。南方局直接领导四川、贵州、云南、广西、广东、湖南、湖北、福建、江西、江苏各省及港澳地区和海外党组织。 1946年5月,国民党政府还都南京,周恩来、董必武率中共代表团、重庆南方局迁到南京。同月,重庆南方局改称中共中央南京局。