良渚博物院的展览主题是：良渚遗址实证中华五千年文明史。博物院占地面积4万平方米，建筑面积1万平方米，展览面积4000多平方米，内设3个常规展厅、1个临时展厅以及文物专用库房和为公众开放的休闲场所等功能区块。良渚博物馆建筑，以一把玉锥散落地面为设计理念，由不完全平行的四个长条形建筑组成，被称为收藏珍宝的盒子。整个建筑凸显简约、粗犷、厚重、大气的特征，注重景观与自然的结合，在依山傍水、野草凄凄的景致中，置于蓝天白云间，让人强烈地感受到一种艺术与自然、历史与现代的和谐融和。建筑外墙全部用黄洞石砌成，远看犹如玉质般浑然一体。院内穿插设计了三个天井式主题庭院，运用中国园林建筑的元素，点缀美人靠等建筑小品。