纪念馆由地面、地下两部分共同组成：地面展示部分以原兵工厂老旧建筑为载体，抗战大后方为主题，叙述性展示卢沟桥事变后，日本大举侵略中国，直逼南京。在形势非常危急之际，重庆成为抗战大后方及政治、经济、军事、文化和外交活动中心。地下展示部分以重庆抗战文化遗址防空洞为载体,重庆大轰炸为主题，展现重庆人民在日军大轰炸面前，不畏强暴，不屈不饶，血战到底的英雄气概。