锦州市博物馆设有保管、陈列、宣教、古建筑保护部及保卫部等专业和行政部室。多年来，对藏品实行科学管理，使藏品得到了应有的保护。并陆续推出《甲午忠魂》、《辽西走廊历史文明》、《馆藏精品展》、《辽西民俗》、《馆藏瓷器》、《宗教艺术》、《辽西抗日义勇军之歌》等基本陈列。同时还引进《辽西古生物化石》及《道光廿五出土文物》等展览。