沙坡头沙漠博物馆位于景区南部，在这里可以了解到沙漠科普知识，认识沙漠的历史文化，还可以参与沙漠互动游戏，除了文物和其他展品陈列，这里的现代化展览手段也很丰富，充满乐趣。