1934年由苇庵法师和觉一法师，在蓝昌源等居士协助下，成立一所佛教女众十方丛林，作为供僧侣清修的场地。由于大量难民随著国共内战影响而涌入香港，不少聚居于黄大仙及钻石山一带的木屋区，社会福利服务的需求甚大，志莲净苑于1948年开办义学为贫穷儿童提供教育机会。1957年开办非牟利的孤儿院及安老院，收容贫苦无依。与志莲净苑相对应的南莲园池是一座古式园林，面积达3.5万平方米，山、水、林木和建筑小品的建设和布局，均依照唐代。