该庙南北宽59米，东西长84米，两进院布局。遒劲有力的三皇庙镶嵌在山门的门额上。中轴线建有乐楼、三皇殿。头院空阔，北角设砖券山门，二进院北角设掖门为一、二进院出入通道。两进院落自然地平落差较大，故掖门前设踏步缓解。三皇殿坐西向东，面阔三间，进深四架椽，梁架为三椽，前压搭牵用三柱，单檐硬山顶前廊式。三皇殿内仍保存元代结构。三皇殿门上方挂有匾额，书写三皇庙为明万历十年十月四川按察使梁明翰赠。殿内正面供奉太吴伏羲、神农炎帝、轩辕黄帝，两侧配祀古代十大名医，山墙绘有行医图壁画，壁画色彩明艳，线条清晰。大殿对面乐楼坐东向西，面阔三间，进深五架椽，单檐卷棚顶。前后台隔架和顶棚全为彩画木式组成，台口四周有木、砖、石雕刻清代遗构。台口上方高悬民国八年所刻匾额一块，上书海市蜃楼，由晚清书法名家秦龙光所书。乐楼藻井彩绘梁山好汉一百零八将，神彩各异，栩栩如生。前后台间，镶嵌大块玻璃为整座戏台增光添彩，时有玻璃戏台的美誉，曾形成邑内外为看戏台而看戏的时尚。