海盐县博物馆重要藏品有：崧泽文化早期玉器璜、玦、崧泽文化早期红陶三足壶、崧泽文化晚期玉钺、崧泽良渚过渡期玉龙首饰、崧泽良渚过渡期彩绘陶壶、崧泽良渚过渡期彩绘陶豆、良渚文化时期的玉钺、玉璧、玉镯、玉刻划纹锥形饰、石钺、石质斜把破土器、泥质袋足灰陶嚣、刻划干栏式建筑的陶器盖、商代青铜瓯、战国原始瓷编钟乐器组合、东汉釉陶堆塑五联罐、三国青瓷四系罐、西晋越窑羊形水注、北宋雄节第一指挥第三都朱记铜军印、南宋嘉兴府澈浦驻扎殿前司水军第一将印铜军印、南宋殿前司平江府许浦驻扎水军第一将印铜军印、南宋嘉兴府金山防海水军统领印铜军印、南宋嘉兴府驻扎殿前司金山水军第二将印铜军印、元代龙泉窑青瓷三足炉、明代珐华器、明代朱朴绢本《寻僧访隐图》、明代文征明《枯木幽兰图》轴等。