六朝博物馆就在南京总统府隔壁，馆址是原六朝建康城的一部分，由世界著名建筑大师贝聿铭之子贝建中先生领衔设计，所以贝氏建筑标志性的几何线条和建筑光影似曾相识。比起苏博的娟秀，六朝博物馆显得更为大气。从公元3世纪初到6世纪末，东吴、东晋、宋、齐、梁、陈六个朝代合称六朝。六朝时期建都南京，南京因此习称六朝古都。六朝时期的南京城也是世界上第一个人口超过百万的城市，和古罗马城并称为世界古典文明两大中心。六朝博物馆是展示六朝文物最全面的遗址博物馆，也是反映六朝文化最系统的专题博物馆。展出青瓷器、陶俑、墓志、建筑构件、石刻、书画等大量珍贵文物以及六朝建康城城墙和大型排水设施遗迹，并介绍六朝名人故事，分四个篇章阐述公元3至6世纪的东方大都会主题，设有六朝帝都、回望六朝、六朝风采、六朝人杰四大展厅。展品主要集中在青瓷、陶俑、碑刻和建筑构件等容易保存的文物。很遗憾由于年代久远，六朝时代的字画所剩无几，即使后朝临摹的也足以成为国宝。