齐云山历史南宋宝庆年间公元12251227年，崇慕道教的方士、居士相继来山，择地筑构，初创佑圣真武祠于齐云岩。 明洪武十五年公元1382年朝廷置道会司于县城崇寿观，主领全县道教事，山上道士有被任命为道会司的。嘉靖十一年公元1532年龙虎山正一嗣教真人张天师驻山，因世宗祈嗣灵应，敕建玄天太素宫，置真人府，配各级道官：太素宫置提点，真人府设赞教、知事，山、庙有住持，县设道会司，州设道正司，府设道纪司，中枢最高设道箓司等机构。清朝沿袭明制。同治、光绪以后，朝廷频因内忧外患，裁撤道官职司，山各道房公推有威望的道士任道长，任期三年，再选可以连任，相沿至民国初年。民国二十三年1934年，休宁县国民政府设置齐云山管理委员会。民国二十九年1940年六月，太素宫前殿倾坍，为整修宫殿，县政府将管理委员会改组为整理委员会。民国三十五年1946年九月，因香市人杂，维持治安，设置驻山警察分队。1949年，中华人民共和国成立后，在土地改革运动中，齐云山整个风景区内的山场田地，分别属于岩前镇、渠口乡和黟县的渔亭镇，划归农民所有。 文化大革命的十年动乱19661976年期间，齐云山又遭受空前破坏，幸存的古建筑、文物等几乎被毁坏殆尽。 1979年以后，为保护文化遗产和开发旅游事业，人民政府先后成立了齐云山管理处和齐云山道教协会。 1981年，成立齐云山管理处，齐云山亦被列为省级重点风景名胜区。 1994年被国务院批准为国家级风景名胜区。