始建于西晋太康年间280289，初名白云庙。唐中宗神龙元年705建观，初名中兴。后改龙兴观为开元，而以观为隆兴。宋大中祥符间1008，改天庆。元成 宗元贞元年，改玄妙取《道德经》玄之又玄，众妙之门之意。清康熙七年1668，为避圣祖玄烨之讳，又名元妙观，此名称沿用至今。明清两代管理道教的道纪司都设在元妙观内。清末以来屡遭破坏 、占用，日渐废圮，至文革中毁坏殆尽，全观只存中殿左脊一角四间。1996年，政府规划土地用于元妙观的复建。第一期工程在原址复建三清殿，已于1999年12月竣工。