1999年阿曼国王捐资20万美元，沙特国王捐资30万美元，摩洛哥政府也捐助10万迪拉姆。2002年该馆正式动工，两年后建成 。主要展示宋元时期的伊斯兰石刻文物，包括墓碑、碑刻、墓葬构件、寺庙建筑构件等，还有相关文献资料以及来自阿拉伯国家的文物资料 。

泉州伊斯兰文化陈列馆的重点展览包括：宋元时期伊斯兰石刻文物：如墓碑、碑刻、墓葬构件等，这些文物展示了伊斯兰文化在泉州的历史遗迹，是了解泉州多元文化的重要窗口。阿拉伯-波斯人在泉州：该展览介绍了宋元时期移民到泉州的阿拉伯及波斯人的文化和生活，包括他们的宗教信仰、习俗等。伊斯兰风格的墓棺：这些墓棺展示了伊斯兰独特的丧葬文化。此外，泉州伊斯兰文化陈列馆还会根据实际情况举办临时展览，具体展览内容可能会根据时间而有所变化，建议前往时提前了解相关信息。

泉州伊斯兰文化陈列馆是泉州海交馆的二期工程的一部分，总建筑面积6000平方米，主要陈列在泉州出土的宋元时期伊斯兰石刻文物，包括墓碑、碑刻、墓葬构件、寺庙建筑构件、历史资料，以及来自阿拉伯国家的文物资料等。