如今的万佛寺，占地1310亩，主建筑380亩，附属建筑300亩，林木花园苗圃570亩，放生海60亩，山门高达23米，宽60米，大雄宝殿层高30米，还有天王殿，钟鼓楼，法堂，方丈楼等。

宋风古韵，都市禅堂，全部仿照大宋祥符兴盛时期建设的佛教圣地其系列仿古建筑如内外山门、天王殿、钟鼓楼、大雄宝殿等，还有依山势而建的百亩天然放生池等等，错落有致，淡雅寂静。

自古以来，福州名寺就有西旗东鼓，旗鼓相当之说。这里所说的西旗，指的就是旗山万佛寺。旗山万佛寺，原名石松寺，始建于宋大中祥符三年1010，初名灵凤寺。绍兴十年1140寺僧天石于寺旁种植龙爪松长成，易名为石松寺。福州旗山万佛寺大雄宝殿是亚洲最大的中西合璧的宫殿式建筑。它是现代建筑的设计者在潜心研究中国古代皇宫和亚洲寺庙建筑风格的基础上，根据旗山地形设计而成的建筑精品。旗山万佛寺是目前中国占地规模最大的佛教寺院。旗山万佛寺除占地面积大之外，还有一大特色就是，寺内所建的系列建筑均是仿古的，雕梁画栋，古朴典雅，如天王殿、钟鼓楼、大雄宝殿、学戒堂、念佛堂、般若堂。其中，兴复于明万历年间的大雄宝殿，面阔五间，进深七柱，层高30米，正面青石龙柱12根，规模堪称同类建筑全国之最。殿中斗拱、柱头等采用的均是宋代的榫卯连接构筑方法，这在殿宇重建中较为少见。